Enciklopedija Crne Gore se ne sagledava isključivo kao naučni i kulturni projekat, već i kao dokument trajanja i identiteta. Njena misija jeste da objedini saznanja o prirodi, državi i društvu, i kulturi Crne Gore, predstavljajući je kao prostor susreta različitih etničkih, vjerskih i kulturnih zajednica. Ona afirmiše ideju Crne Gore kao multikulturne i građanske zajednice, u kojoj se kroz istoriju prepoznaje kontinuirano prožimanje različitih kulturnih horizonata – od antičkih i srednjovjekovnih nasljeđa do modernih i savremenih procesa. Ona ne teži jednostavnom katalogizovanju, već sistematičnom prikazu složenosti i slojevitosti kulturnih, društvenih i prirodnih fenomena. Izrada Enciklopedije Crne Gore zasniva se na opšteprihvaćenim leksikografskim načelima i kriterijumima (načelo teritorijalnosti – obuhvata sve fenomene vezane za prostor današnje Crne Gore, ali i pojave i ličnosti izvan nje koje su bile od značaja za crnogorsku istoriju i kulturu; načelo istoričnosti – oslanja se na kontinuitet događaja, procesa i identiteta od najstarijih vremena do savremenosti; načelo obuhvatnosti – nastoji da prikaže složenost i višeslojnost kulturnog, društvenog i prirodnog tkiva Crne Gore; kriterijum relevantnosti – vrednovanje značaja, uloge i uticaja pojava, događaja i ličnosti za prirodu, državu i društvo i kulturu Crne Gore; kriterijum objektivnosti – zasnivanje iskaza na osnovu činjenica utemeljenih na saznanjima savremene nauke; statusno-funkcionalni kriterijum – odnosi se na status institucija, kao i na funkcije, zvanja i titule ličnosti u istoriji ili savremenosti Crne Gore
Enciklopedija Crne Gore se zasniva na interdisciplinarnom pristupu i saradnji nacionalnih i međunarodnih naučnih institucija. Imaće svoj štampani i internetski oblik, što će omogućiti stalno dopunjavanje i ažuriranje sadržaja i što će ovom projektu dati trajni karakter. Enciklopedija Crne Gore biće prevedena na strane jezike čime će postati dostupna široj međunarodnoj publici i time doprinijeti afirmaciji Crne Gore u evropskoj i svjetskoj kulturi.